डिजिटल हस्ताक्षर का उपयोग संगठन के कई सूचना प्रणाली अनुप्रयोगों (उदाहरण के लिए, परीक्षा रिपोर्ट, रजिस्टर, संग्रह और भुगतान आदेश) द्वारा किया जाता है और इसका उपयोग अनुप्रयोगों के बाहर स्वतंत्र रूप से उत्पन्न डिजिटल दस्तावेजों पर हस्ताक्षर करने के लिए भी किया जा सकता है।